MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 53874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008260	GCA	2	6	57	62	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832862
2	NC_008260	TGC	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832862
3	NC_008260	TGG	2	6	146	151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832862
4	NC_008260	GCA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832862
5	NC_008260	TCC	4	12	286	297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110832862
6	NC_008260	ACG	2	6	316	321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832862
7	NC_008260	GCA	2	6	404	409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832862
8	NC_008260	GCG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832862
9	NC_008260	GCAGC	2	10	475	484	20 %	0 %	40 %	40 %	110832862
10	NC_008260	TGG	2	6	534	539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832862
11	NC_008260	ATGC	2	8	565	572	25 %	25 %	25 %	25 %	110832862
12	NC_008260	GTT	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110832862
13	NC_008260	GGT	2	6	612	617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832862
14	NC_008260	CTG	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832862
15	NC_008260	TGA	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832862
16	NC_008260	T	6	6	736	741	0 %	100 %	0 %	0 %	110832862
17	NC_008260	AGG	2	6	761	766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110832862
18	NC_008260	T	6	6	769	774	0 %	100 %	0 %	0 %	110832862
19	NC_008260	TTGG	2	8	878	885	0 %	50 %	50 %	0 %	110832862
20	NC_008260	GCC	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110832862
21	NC_008260	A	6	6	943	948	100 %	0 %	0 %	0 %	110832862
22	NC_008260	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832862
23	NC_008260	ATG	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832862
24	NC_008260	CTT	2	6	987	992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110832862
25	NC_008260	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110832862
26	NC_008260	TAC	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110832862
27	NC_008260	ACG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832862
28	NC_008260	TGG	2	6	1308	1313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832862
29	NC_008260	AATCC	2	10	1367	1376	40 %	20 %	0 %	40 %	110832862
30	NC_008260	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832862
31	NC_008260	TCAA	2	8	1487	1494	50 %	25 %	0 %	25 %	110832863
32	NC_008260	GCT	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832863
33	NC_008260	CAG	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832863
34	NC_008260	GTG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832863
35	NC_008260	CTAT	2	8	1601	1608	25 %	50 %	0 %	25 %	110832863
36	NC_008260	ACC	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832863
37	NC_008260	CGG	2	6	1725	1730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832863
38	NC_008260	GTTC	2	8	1772	1779	0 %	50 %	25 %	25 %	110832863
39	NC_008260	GAA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832863
40	NC_008260	TGAT	2	8	1890	1897	25 %	50 %	25 %	0 %	110832863
41	NC_008260	CAG	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832863
42	NC_008260	TGCG	2	8	1977	1984	0 %	25 %	50 %	25 %	110832863
43	NC_008260	AGTT	2	8	2181	2188	25 %	50 %	25 %	0 %	110832863
44	NC_008260	GAAG	2	8	2224	2231	50 %	0 %	50 %	0 %	110832863
45	NC_008260	GGT	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832863
46	NC_008260	GTG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832863
47	NC_008260	AAC	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110832863
48	NC_008260	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832863
49	NC_008260	GAA	3	9	2384	2392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832863
50	NC_008260	ATAGCA	2	12	2502	2513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110832863
51	NC_008260	ATTT	2	8	2789	2796	25 %	75 %	0 %	0 %	110832864
52	NC_008260	GTG	2	6	2823	2828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832864
53	NC_008260	GCC	2	6	2864	2869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110832864
54	NC_008260	TGGT	2	8	2886	2893	0 %	50 %	50 %	0 %	110832864
55	NC_008260	G	6	6	2933	2938	0 %	0 %	100 %	0 %	110832864
56	NC_008260	CTGTT	2	10	2991	3000	0 %	60 %	20 %	20 %	110832864
57	NC_008260	CGT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832864
58	NC_008260	GC	3	6	3118	3123	0 %	0 %	50 %	50 %	110832864
59	NC_008260	CCG	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110832864
60	NC_008260	AGC	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832864
61	NC_008260	GCT	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832864
62	NC_008260	TGA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832864
63	NC_008260	TGA	2	6	3385	3390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832864
64	NC_008260	GCG	2	6	3394	3399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832864
65	NC_008260	AG	3	6	3442	3447	50 %	0 %	50 %	0 %	110832864
66	NC_008260	AGTC	2	8	3536	3543	25 %	25 %	25 %	25 %	110832864
67	NC_008260	CTG	2	6	3560	3565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832864
68	NC_008260	GAT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832864
69	NC_008260	GGC	2	6	3577	3582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832864
70	NC_008260	CCA	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832864
71	NC_008260	TAATGA	2	12	3688	3699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	110832864
72	NC_008260	GTCG	2	8	3709	3716	0 %	25 %	50 %	25 %	110832864
73	NC_008260	A	6	6	3794	3799	100 %	0 %	0 %	0 %	110832865
74	NC_008260	CGTA	2	8	3841	3848	25 %	25 %	25 %	25 %	110832865
75	NC_008260	GAT	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
76	NC_008260	CAC	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832865
77	NC_008260	ATCC	2	8	3974	3981	25 %	25 %	0 %	50 %	110832865
78	NC_008260	GAA	2	6	4040	4045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832865
79	NC_008260	GCA	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832865
80	NC_008260	TGC	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832865
81	NC_008260	TGG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
82	NC_008260	CGA	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832865
83	NC_008260	GGT	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
84	NC_008260	AGA	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832865
85	NC_008260	AGT	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
86	NC_008260	GATG	2	8	4399	4406	25 %	25 %	50 %	0 %	110832865
87	NC_008260	TGA	2	6	4417	4422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
88	NC_008260	TCT	2	6	4584	4589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110832865
89	NC_008260	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110832865
90	NC_008260	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
91	NC_008260	AGG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110832865
92	NC_008260	AAG	2	6	4697	4702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832865
93	NC_008260	TGA	2	6	4723	4728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
94	NC_008260	CCAG	2	8	4785	4792	25 %	0 %	25 %	50 %	110832865
95	NC_008260	TCC	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110832865
96	NC_008260	ATT	2	6	4863	4868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110832865
97	NC_008260	A	6	6	4905	4910	100 %	0 %	0 %	0 %	110832865
98	NC_008260	GC	3	6	4974	4979	0 %	0 %	50 %	50 %	110832865
99	NC_008260	CAG	2	6	5018	5023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832865
100	NC_008260	GGT	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
101	NC_008260	TCT	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110832865
102	NC_008260	ACC	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832865
103	NC_008260	ATC	3	9	5264	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110832865
104	NC_008260	CA	3	6	5298	5303	50 %	0 %	0 %	50 %	110832865
105	NC_008260	CTG	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832865
106	NC_008260	CTT	3	9	5323	5331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110832865
107	NC_008260	CCG	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110832865
108	NC_008260	GAA	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832865
109	NC_008260	GCAA	2	8	5406	5413	50 %	0 %	25 %	25 %	110832865
110	NC_008260	ACCT	2	8	5417	5424	25 %	25 %	0 %	50 %	110832865
111	NC_008260	GAT	2	6	5429	5434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
112	NC_008260	GGA	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110832865
113	NC_008260	ACC	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832865
114	NC_008260	CAC	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832865
115	NC_008260	GTG	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
116	NC_008260	GTG	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
117	NC_008260	GAA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832865
118	NC_008260	GAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
119	NC_008260	ACG	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832865
120	NC_008260	ATG	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
121	NC_008260	GAG	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110832865
122	NC_008260	GCTC	2	8	5785	5792	0 %	25 %	25 %	50 %	110832865
123	NC_008260	GCTG	2	8	5887	5894	0 %	25 %	50 %	25 %	110832865
124	NC_008260	GTG	2	6	5913	5918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832865
125	NC_008260	TCG	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832865
126	NC_008260	ACC	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832865
127	NC_008260	CCTG	2	8	6120	6127	0 %	25 %	25 %	50 %	110832865
128	NC_008260	TGA	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832865
129	NC_008260	TGT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110832866
130	NC_008260	GAC	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832866
131	NC_008260	T	6	6	6442	6447	0 %	100 %	0 %	0 %	110832866
132	NC_008260	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832866
133	NC_008260	AGT	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832866
134	NC_008260	T	7	7	6467	6473	0 %	100 %	0 %	0 %	110832866
135	NC_008260	CAG	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832866
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261	NC_008260	CTGG	2	8	14292	14299	0 %	25 %	50 %	25 %	110832873
262	NC_008260	GAT	2	6	14348	14353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832873
263	NC_008260	CAC	2	6	14394	14399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832873
264	NC_008260	CGG	2	6	14503	14508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832873
265	NC_008260	TGG	2	6	14577	14582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832873
266	NC_008260	GCG	2	6	14693	14698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832873
267	NC_008260	CAGC	2	8	14755	14762	25 %	0 %	25 %	50 %	110832873
268	NC_008260	CTG	2	6	14765	14770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832873
269	NC_008260	CATTGC	2	12	15019	15030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110832874
270	NC_008260	ACC	2	6	15044	15049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110832874
271	NC_008260	TGACG	2	10	15082	15091	20 %	20 %	40 %	20 %	110832874
272	NC_008260	ACA	2	6	15208	15213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110832874
273	NC_008260	TGA	2	6	15217	15222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832874
274	NC_008260	TGC	2	6	15249	15254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832874
275	NC_008260	ATC	2	6	15278	15283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110832874
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277	NC_008260	ATCA	2	8	15374	15381	50 %	25 %	0 %	25 %	110832874
278	NC_008260	GGTG	2	8	15460	15467	0 %	25 %	75 %	0 %	110832874
279	NC_008260	TTG	2	6	15491	15496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110832874
280	NC_008260	GCG	2	6	15542	15547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832874
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282	NC_008260	GCA	2	6	15691	15696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832874
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284	NC_008260	AGC	2	6	15726	15731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110832874
285	NC_008260	GAG	2	6	15738	15743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110832874
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287	NC_008260	GGC	2	6	15809	15814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832874
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289	NC_008260	GCG	2	6	15900	15905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832874
290	NC_008260	TGG	2	6	15958	15963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832874
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293	NC_008260	GCG	2	6	16032	16037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832874
294	NC_008260	GA	3	6	16066	16071	50 %	0 %	50 %	0 %	110832874
295	NC_008260	TGG	2	6	16158	16163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110832874
296	NC_008260	CTGG	2	8	16183	16190	0 %	25 %	50 %	25 %	110832874
297	NC_008260	GCTC	2	8	16240	16247	0 %	25 %	25 %	50 %	110832874
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301	NC_008260	TGA	2	6	16589	16594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832875
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303	NC_008260	TGA	2	6	16676	16681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110832875
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379	NC_008260	TTGGCG	2	12	19876	19887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110832878
380	NC_008260	GTGC	2	8	19912	19919	0 %	25 %	50 %	25 %	110832878
381	NC_008260	TTGA	2	8	19996	20003	25 %	50 %	25 %	0 %	110832878
382	NC_008260	AAACT	2	10	20039	20048	60 %	20 %	0 %	20 %	110832878
383	NC_008260	GAA	2	6	20478	20483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110832879
384	NC_008260	GTCCC	2	10	20507	20516	0 %	20 %	20 %	60 %	110832879
385	NC_008260	CGG	2	6	20539	20544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110832879
386	NC_008260	GC	3	6	20553	20558	0 %	0 %	50 %	50 %	110832879
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388	NC_008260	GCT	2	6	20579	20584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110832879
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